Pasterizace tekutých vajec je jedním z nejsložitějších pasterizačních procesů tekutých produktů kvůli citlivosti vaječných proteinů na teplo a následné ztrátě funkčnosti v konečném produktu, pokud je použita extrémně silná pasterizace.
Rychlost usmrcování pomocí pasterizace WAVE je mnohem lepší než rychlost usmrcování při standardních teplotách v tradičních pasterizačních systémech. Doba ohřevu a doba výdrže pro systém WAVE jsou navrženy tak, aby měly minimální účinek na denaturaci produktu.