Die Pasteurisierung von Flüssigei ist aufgrund der Empfindlichkeit der Eiproteine gegenüber Hitze und dem daraus resultierenden Funktionsverlust im Endprodukt bei extrem starker Pasteurisierung einer der komplexesten Pasteurisierungsprozesse von Flüssigprodukten.
Die Abtötungsrate bei der WAVE-Pasteurisierung ist der Abtötungsrate bei Standardtemperaturen in herkömmlichen Pasteurisierungssystemen weit überlegen. Die Aufheizzeit und die Haltezeit des WAVE-Systems sind so ausgelegt, dass die Denaturierung des Produkts möglichst gering ist.