Pasterizácia tekutých vajec je jedným z najkomplexnejších spôsobov pasterizácie tekutých výrobkov v dôsledku citlivosti vaječných bielkovín na teplo a následnej straty funkčnosti konečného produktu, ak sa použije extrémne silná pasterizácia.
Rýchlosť zabíjania pomocou pasterizácie WAVE je oveľa vyššia ako rýchlosť usmrcovania pri štandardných teplotách v tradičných pasterizačných systémoch. Doba zahrievania a doba udržania pre systém WAVE sú navrhnuté tak, aby mali minimálny vplyv na denaturáciu produktu.